05/29/20
La densité de cluster est un facteur important pour optimiser la qualité et le rendement des données. Le tableau suivant répertorie les densités de cluster brutes recommandées pour des librairies équilibrées (telles que PhiX):
| Plateforme | Mode/Réactifs | Densités de Cluster brutes optimales |
|---|---|---|
| HiSeq™ | High Output, v3 | 750-850 K/mm2 |
| High Output, v4 | 950-1050 K/mm2 | |
| Rapid Run, v2 | 850-1000 K/mm2 | |
| MiSeq™ | v2 | 1000-1200 K/mm2 |
| v3 | 1200-1400 K/mm2 | |
| MiniSeq™ | Mid and High Output | 170-220 K/mm2 |
| NextSeq 500/550™ | Mid and High Output | 170-220 K/mm2 |
*High: Débit élevé; Mid: Débit moyen
Les systèmes iSeq ™ 100, NextSeq ™ 1000 / NextSeq ™ 2000, HiSeq ™ 3000 / HiSeq ™ 4000, HiSeq ™ X et NovaSeq ™ 6000 utilisent des flow cell structurées ce qui se traduit par une densité de cluster fixe, même si tous les nano-puits ne sont pas occupés. Dans ses systèmes, la surveillance du pourcentage de passage du filtre des clusters (% cluster passing filter) est une meilleure mesure de l’occupation potentielle du cluster.
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